Al intentar utilizar Xdebug mediante php-debug en Atom, me sucedía que el debugger abría todo archivo envuelto en el Stack del proceso, no respetando en absoluto los breakpoints configurados.

El problema fue resuelto luego de desactivar todas las casillas de PHP Exceptions en la configuración del plugin.

Fuente: https://github.com/gwomacks/php-debug/issues/144#issuecomment-197302609



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